一：企业规模小高端仪器少

国产仪器的国内市场占有率有所提高，但高档仪器仍然依赖进口。例如我国高校、研究机构、国家重点实验室、国家级分析测试中心等装备的科学仪器，绝大部分是进口产品；钢铁、石油、电力等大中型企业在恶劣工作环境中使用的科学仪器也同样如此。

另一个值得关注的现象是，我国大多数科学仪器企业成立时间较短，小型企业占绝大多数，企业研发投入能力弱，产品挤在少数品种上。为求生存，在激烈的市场竞争中，企业竞相压价，减少了利润空间，同时也降低了研发投入的能力。

2010年，我国具有自主知识产权的原子荧光光度计全国销售量约2000台，生产厂家近10家。一台全自动原子荧光光度计的原材料成本在2.5—3万元之间，市场销售价应在7.5万元以上，但有些公司以4万元的低价大量销售。国内企业间的价格恶性竞争损失的不仅仅是利润，同时还丧失了用户的信任。

二：基础力量弱人才缺口大

某些国产关键零部件水平比较低，只能依赖进口。例如光电倍增管，它是原子光谱、分子光谱仪器必须使用的元器件，直接影响着仪器的灵敏度、稳定性等关键指标。直到现在，该器件仍然要依赖进口，每年仅吉天仪器一个公司就需要使用500—600支进口光电倍增管，花费300—400万元，而且从70年到现在，进口价格上涨了差不多10倍。

由于国家科技经费主要投入高校和科研机构，较少投向企业，企业研发经费主要靠自筹。但企业利润不高，研发资金投入较少，很多时候难以进行持续性投入。

三：缺乏专业的科研机构

在湖北仪天成的调研中发现，情况不容乐观。

截至2010年，正在运行的280家国家重点实验室中，只有3家与科学仪器相关；在总数约350家的国家工程（技术）研究中心、国家工程实验室中，直接与科学仪器设备自主研发相关的也不到10家，而且在企业中尚未建立科学仪器研发的重点实验室和工程技术研究中心。“八五”以来，国家科技计划支持了许多科学仪器研发项目，但由于支持不连续，许多项目完成后，研究团队转向其他领域，承担任务的科研机构、大学和企业尚未形成一定的知识和成果积累，因此无法形成研发基地。

由于我国科学仪器设备生产企业的经济基础和研发基础相对薄弱，因此，长期以来难以吸引优秀人才投身到这个行业工作，导致有经验的仪器设备研发、应用及工程师技术专家十分稀缺。此外，由于大学的学科设置不合理，缺少复合型人才，使企业难以招聘到合适的人才；国际著名跨国公司在我国建立的生产研发基地还出高薪挖走了我国科研机构、企业的高端人才。
    制约我国科学仪器行业快速发展的最大瓶颈是缺乏优秀的研发人才。